Aplikasi Web Untuk Analisis Sekuens Fasta Berbasis Python

Authors

  • Pebi Mina Husania Universitas Islam Negeri Sumatera Utara image/svg+xml Author
  • Tengku Syahvina Rival Dini Universitas Islam Negeri Sumatera Utara image/svg+xml Author
  • Rani Chantika Universitas Islam Negeri Sumatera Utara image/svg+xml Author
  • Puji Sri Alhirani Universitas Islam Negeri Sumatera Utara image/svg+xml Author

DOI:

https://doi.org/10.65244/jggm.v2i1.363

Keywords:

Bioinformatika, FASTA, Aplikasi Web

Abstract

Perkembangan teknologi sekuensing telah menghasilkan data sekuens DNA, RNA, dan protein dalam jumlah besar yang umumnya disimpan dalam format FASTA. Meskipun format ini sederhana dan banyak digunakan, perangkat lunak bioinformatika yang tersedia masih didominasi oleh aplikasi berbasis desktop atau command line interface yang kurang ramah bagi pengguna pemula. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan aplikasi web sederhana berbasis Python untuk analisis dasar file FASTA. Aplikasi dibangun menggunakan framework Flask dan pustaka BioPython untuk melakukan analisis panjang sekuens, komposisi basa nukleotida, serta persentase GC melalui antarmuka web yang mudah digunakan. Metode pengembangan sistem yang digunakan adalah model Waterfall, meliputi analisis kebutuhan, perancangan, implementasi, dan pengujian. Hasil pengujian menunjukkan bahwa aplikasi mampu memproses file FASTA secara akurat dan cepat tanpa memerlukan instalasi perangkat lunak tambahan di sisi pengguna. Aplikasi ini diharapkan dapat menjadi media pembelajaran bioinformatika serta mendukung analisis awal sekuens biologis bagi mahasiswa dan peneliti.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Budiono, A., Adam, C., & Arini, D. (2022). Biopython: Comparing the DNA Polymerase I (polA) Gene of Thermophilic, Mesophilic, and Psychrophilic Bacteria. BiosciED Journal, 3(1), 1–8. Universitas Palangka Raya.

Edi, E. (2020). Bioinformatika: Komputer + Statistika + Matematika + Biologi. Jurnal TIMES, 6(1), 23–25.

Famuji, T. S., Herman, & Sunardi. (2023). Proses Implementasi Bioinformatika Pada Digitalisasi Data Genetika Manusia. Simetris: Jurnal Teknik Mesin, Elektro Dan Ilmu Komputer, 14(1), 1–12. https://doi.org/10.24176/simet.v14i1.9064

Genbinesia. (2023). Bioinformatika Dasar dengan Python 3. Genbinesia Press. https://genbinesia.or.id/wp-content/uploads/2023/05/Bioinformatika-Dasar-dengan-Python-3.pdf

Hadinata, E. (2021). Rancang Bangun Aplikasi Bioinformatika Biokiba Menggunakan Biopython Dan Framework Laminas. Jurnal Abdi Ilmu, 14(1), 117–134. https://journal.pancabudi.ac.id/index.php/abdiilmu/article/view/3946

Lietz, K., Saremi, B., & Wiese, L. (2023). Genealyzer: web application for the analysis and comparison of gene expression data. BMC Bioinformatics, 24(1), 1–17. https://doi.org/10.1186/s12859-023-05266-4

Montecuollo, F., Schmid, G., & Tagliaferri, R. (2017). E2FM: An encrypted and compressed full-text index for collections of genomic sequences. Bioinformatics, 33(18), 2808–2817. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx313

Ngovangari, R. H., Rorimpandey, G. C., Kembuan, O., & Sumual, H. M. (2024). Implementasi Algoritma Needleman-Wunsch dalam Pengujian Tingkat Kemiripan DNA Babi Sulawesi Utara. JOINTER : Journal of Informatics Engineering, 5(01), 20–26. https://doi.org/10.53682/jointer.v5i01.32

Phelan, J., Deelder, W., Ward, D., Campino, S., Hibberd, M. L., & Clark, T. G. (2022). COVID-profiler: a webserver for the analysis of SARS-CoV-2 sequencing data. BMC Bioinformatics, 23(1), 1–5. https://doi.org/10.1186/s12859-022-04632-y

Razsanjani, M. L., Nasution, H., & Novriando, H. (2024). Analisis Performa Web server Python dan Go Pada Protokol Http (Hypertext Transfer Protocol). Juara, Jurnal Aplikasi Dan Riset Informatika, 02(2), 95–103. https://doi.org/10.26418/juara.v2i2.82059

Rifani Khairani Pohan, Juan Dini, Mutiarani Mutiarani, M. Iqbal, & Fatur Rahman. (2024). Pencegahan Penyakit Kanker Payudara dengan Bioinformatika : Membangun Masa Depan Kesehatan. Jurnal Sistem Informasi Dan Ilmu Komputer, 3(1), 129–134. https://doi.org/10.59581/jusiik-widyakarya.v3i1.4489

Sardi, A. (2022). Bioinformatics: Challenges in Integrating Biological Information. Jurnal Biologi Tropis, 22(4), 1297–1301. https://doi.org/10.29303/jbt.v22i4.4346

Sari, I. J., R. Ahmad Zaky El, Suparman, S., & Lutfi, A. (2024). Pemanfaatan Bioinfomatics Tools dalam Pembelajaran Genetika Bagi Dosen Pendidikan Biologi di Salah Satu Universitas Di Ternate. Jurnal Pengabdian Dinamika, 11(2), 45–61.

Shen, W., Le, S., Li, Y., & Hu, F. (2016). SeqKit: A cross-platform and ultrafast toolkit for FASTA/Q file manipulation. PLoS ONE, 11(10), 1–10. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0163962

Shendre, A., Mehta, N. K., Rathore, A. S., Kumar, N., Patiyal, S., & Raghava, G. P. S. (2025). MAP Format for Representing Chemical Modifications, Annotations, and Mutations in Protein Sequences: An Extension of the FASTA Format. ArXiv Preprint ArXiv:2505.03403, 302.

Tian, R., & Imanian, B. (2022). ASAP 2: a pipeline and web server to analyze marker gene amplicon sequencing data automatically and consistently. BMC Bioinformatics, 23(1), 1–12. https://doi.org/10.1186/s12859-021-04555-0

Zhou, D., Tran, Y., Abou Elela, S., & Scott, M. S. (2022). SAPFIR: A webserver for the identification of alternative protein features. BMC Bioinformatics, 23(1), 1–13. https://doi.org/10.1186/s12859-022-04804-w.

Published

2026-02-26

How to Cite

Aplikasi Web Untuk Analisis Sekuens Fasta Berbasis Python. (2026). Journal of Golden Generation Multidisciplinary , 2(1), 1024-1042. https://doi.org/10.65244/jggm.v2i1.363

Similar Articles

You may also start an advanced similarity search for this article.